长时间憋尿出现肾区疼痛，主要原因是膀胱内尿液反流，进入输尿管以及肾盂，导致肾盂内压力增大，引起肾区疼痛。正常情况下，膀胱内的压力大于输尿管的压力，但输尿管口有抗反流的作用，膀胱内的尿液不会通过输尿管口，逆行进入输尿管以及肾盂。当憋尿时，膀胱压力明显增高，超过输尿管抗反流作用，此时尿液会通过输尿管口，逆行进入输尿管以及肾盂，导致肾盂局部扩张积水，肾盂压力增高就出现肾区疼痛。
憋尿的坏处经常憋尿对肾脏功能会产生损害，憋尿会有很多危害，比如下面的一些症状：
1、泌尿系统感染
是指病原体在尿路中异常繁殖所致的感染性疾病。患者常表现为尿频、尿急、尿痛、下腹痛等不适症状，也有可能出现发热、寒战等全身症状，以及一憋尿肾脏的位置就隐隐的疼的现象，因为尿液是人体废物排泄的主要途径。如果经常憋尿，尿液会在膀胱和肾脏堆积，废物沉积形成沉淀物，容易诱发尿路炎症或感染。
2、肾结石
是指晶体物质如钙，草酸盐，尿酸盐等，从尿液中析出并沉积于肾脏，属于上尿路结石。发病可能与代谢异常、生活方式等多种因素有关。患者常见的症状有疼痛、血尿、恶心呕吐等，还可能会出现一憋尿肾脏的位置就隐隐的疼的现象。患者可以在医生指导下应用药物进行治疗，如肾石通颗粒、排石颗粒等。
肾结石3、腰部胀痛
尿液反流容易引起肾盂肾炎以及肾脏积水，会引起肾脏功能损害，肾脏的严重积水可以引起神经性的反射，导致出现腰部胀痛，甚至出现肾功能的受损。
4、尿失禁
从而导致的肾脏胀痛的现象，可以通过排出尿来缓解症状，而且一般情况下不建议患者进行憋尿，因为憋尿可能会导致一些不良并发症，比如膀胱破裂，膀胱组织有一定程度的松弛，但持续排尿容易导致膀胱破裂，病情危重，严重的可以导致患者尿失禁的现象。
5、尿毒症
长期憋尿对肾功能伤害比较大，容易导致慢性肾功能不全，长期发展会转为尿毒症。
6、心脑血管疾病
长期憋尿可以导致患者总是处于紧张状态，高血压病人容易引起脑血管意外、心律失常等情况。
7、肾积水
如果长时间憋尿可以导致肾积水，膀胱内存储一定的量的尿液以后，尿液并不会向肾脏内反流，但是当长时间大量憋尿超过一定的压力时，尿液就会由膀胱进入输尿管流至肾脏之内，久而久之就会形成双肾积水。当发生双肾积水以后，如果仍然存在有长时间大量憋尿的诱因，则可能会逐渐出现肾功能不全的表现。
肾积水长时间憋尿是一种不好的习惯，憋尿时间过长，轻者下腹部胀痛、不适。当膀胱过度充盈时间较长时，可能会造成膀胱收缩力短时间丧失，导致无法排尿或排尿无力、间断排尿的情况，严重的患者可能需要留置导尿管才能缓解症状。
总之尽量避免长时间憋尿，导致膀胱功能受损，要养成定期检查的习惯，对于一些病理性的因素，及时针对病因进行相应的治疗。平时一定要多喝饮水，多排尿，这样才能保护身体的健康，远离疾病。